財政部臺北國稅局表示，總機構在我國境外之營利事業經核准適用所得稅法第25條規定核計所得額者，不得扣除其在臺分支機構之當年度虧損。

該局說明，依財政部96年5月11日台財稅字第09604500060號函規定，總機構在我國境外之營利事業，在我國境內經營國際運輸、承包營建工程、提供技術服務或出租機器設備等業務，其成本費用分攤計算困難，且申請財政部核准或由財政部核定依所得稅法第25條規定，國際運輸業務按其在我國境內之營業收入10%，其餘業務按15%核計營利事業所得額者，該所得額不得扣除其在臺分支機構之當年度虧損後，再行核課。

該局舉例說明，美商A公司在我國境內設有甲分公司，A公司於112年間直接對我國乙公司提供技術服務，並經核准適用所得稅法第25條規定，按其取得乙公司技術服務收入新臺幣（下同）700萬元之15%核計A公司於我國境內之營利事業所得額105萬元（700萬元×15%）。嗣甲分公司於辦理112年度營利事業所得稅結算申報時，誤將A公司所得額105萬元扣除甲分公司當年度營業虧損70萬元後，申報課稅所得額35萬元（105萬元-70萬元），應納稅額7萬元（35萬元×稅率20%），惟依上開規定，A公司所得額尚不得扣除甲分公司之虧損，爰經該局調增課稅所得額70萬元，補徵稅額14萬元（70萬元×稅率20%）。

(資料來源:臺北國稅局)