財政部表示，109年11月25日修正發布「適用所得稅協定相互協議程序作業要點」(以下簡稱本要點)第10點之1，規定跨境雙邊或多邊預先訂價協議(以下簡稱BAPA)申請人如於BAPA簽署前變更稅籍登記之營業地址，致遷址後由不同稽徵機關管轄者，應由申請人於BAPA適用期間第1個會計年度營利事業所得稅結算申報所轄稽徵機關，獲授權與協定夥伴國進行相互協議程序(以下簡稱MAP)。申請人應於核准變更稅籍登記之日起14日內通知我國主管機關(該部國際財政司)，以利審查是否需變更授權。

財政部舉例說明，我國A公司稅籍登記之營業地址位於臺北市，107年11月1日依本要點第10點申請BAPA，適用期間為107年1月1日至111年12月31日；經審核符合相關規定，我國主管機關授權臺北國稅局與協定夥伴國進行MAP。A公司於108年變更稅籍登記之營業地址至高雄市，應依規定於核准變更登記之日起14日內通知我國主管機關，後續可能情形如下：

    (一) 倘A公司於108年3月經核准變更稅籍登記，該公司107年度營利事業所得稅結算申報應於108年5月向高雄國稅局辦理，爰我國主管機關應變更授權由高雄國稅局進行MAP。

    (二) 倘A公司於108年9月經核准變更稅籍登記，該公司107年度營利事業所得稅結算申報仍向臺北國稅局辦理，我國主管機關無需變更授權。

財政部說明，本次修正係考量BAPA案件通常涵蓋數個會計年度，申請人可能於BAPA協商過程中變更稅務管轄區，允宜明定授權原則，以提升行政程序確定性及進行MAP效率，保障申請人權利。有關MAP資訊(包括法規、申請書表、流程圖及統計報告)，登載於財政部網站相互協議程序專區(路徑：財政部首頁>服務園地>國際財政服務資訊>相互協議程序)，歡迎瀏覽運用。